三坐標測量儀可根據應用選擇有兩種方式：手動和自動。如果您只需要檢測幾何量和公差都比較簡單的工件，或測量各種小批量的不盡相同的工件，手動儀器是最佳選擇。手動測量機的軟件也可儲存和調用測量程序，從而加快了重復性測量。如果需要檢測大批量相同的工件，或要求較高的精度，要選擇直接用計算機控制的測量機。數控測量機可自動檢測并消除操作者對測量結果的影響。程序驅動意味著可實現無誤差的高檢測速度。
公差也非常重要，手動測量機很難達到更小的公差要求，而數控測量機通過其連續的觸測使其更適合具有嚴格公差要求工件的高精度和高重復性要求。
數控測量機通過安裝一個模擬掃描測頭，用于測量要求大量的數據來定義它們的幾何量的工件，如：齒輪、圓柱體、汽車車身、擋風玻璃的測量。對于那些完全用算術方法YDD定義或是完全未知的工件來說，這些測頭能夠提供連續的數據采集，并可從部分工件和模型上進行逆向工程。對于非常小輪廓形工件來說，掃描測頭因其小的掃描面并需要大量數據來進行定義而成為理想的選擇。
三坐標測量儀安裝的場地也很重要。理想情況是，測量機應盡量靠近生產過程中制造工件的操作者附近安裝。這些車間型測量機一般具有友好的用戶操作接口，具有與機床類似的控制界面。
不同型號的三坐標測量儀可以共同工作。一臺計量型的垂直式測量機一般使用的精密計量室，作為產品性能的主仲裁，工作型的測量機使用在生產線，對工件的質量進行評判，并提供實時的統計過程控制，并平滑地與整個制造流程規劃進行過渡。